A ładowanie mierzyłeś ? Sprawdziłeś w jakim stanie pasek ? Piszesz, że aku na wykończeniu, a dziwisz, się, że alternator piszczy. Czytaj: stawia opór, bo próbuje doładować zdechnięty aku, więc piszczy paskiem.
Jak na razie, to odnoszę wrażenie, że kupiłeś/dostałeś truposza, a oczekujesz od niego cudów.
Auto w tym wieku, zwłaszcza jeśli nie było regularnie i sumiennie serwisowane, ma pełne prawo mieć niedomagania, które albo usuniesz (a to będzie kosztować), albo nie usuniesz i oddasz do huty.
Co do spadku obrotów na D i R - skoro skrzynia stawia silnikowi opór, to przecież normalne, że go nieco przydławi. Wyczyść i wyreguluj przepustnicę, wtedy nie będzie to aż tak odczuwalne.